In der Beschreibung des Vorhabens im Zuge der Elektrifizierung und Adaptierung wird die Haltestelle nicht erwähnt, auch im neuen VDV scheint die Haltestelle Weikendorf nicht mehr auf,
Wenn die S1 so wie im VDV-Fahrplanentwurf vorgesehen nach Marchegg verlängert wird, ist der Bahnsteig in Weikendorf jedenfalls zu kurz. Wenn man sich den VDV-Fahrplanentwurf genauer ansieht, könnte es noch einen anderen Grund für eine Haltauflassung geben: Ab dem Fahrplan 2023 sollen die REX Wien Hbf. - Bratislava hl. st. deutlich beschleunigt werden. Um die Anschlüsse in Marchegg von der Schnellbahn aus Gänserndorf zum REX Richtung Bratislava zu gewährleisten, muss offenbar die Fahrzeit von derzeit 18 Minuten zwischen Gänserndorf und Marchegg auf 14 Minuten gesenkt werden. Möglicherweise reicht der Ausbau auf 120 km/h für dieses Ziel nicht aus und es muss daher der Halt in Weikendorf dran glauben.